En 1957 comenzó una larga carrera de méritos y oposición en el CASMU, primero como Practicante Centralizado, luego en 1966 como Médico de Urgencia y más tarde, como Médico de Emergencia, Médico Interno de Sanatorio, Médico Internista, y Médico Coordinador, cargo en el que continuó hasta su retiro.
En 1969, obtuvo el cargo de Médico del MSP por concurso de oposición y méritos.
Todos los cargos que ocupó, tanto en la Facultad como en las demás instituciones en que actuó, fueron obtenidos por concurso, llegando a ocupar en todos ellos el máximo escalafón.
Actuó como Médico Internista y como Neumólogo, con reconocimiento por la Escuela de Graduados por competencia notoria.
Fue Presidente de la Sociedad de Medicina de Montevideo, la primera del país, en 1980.
Fundador y Presidente de la Sociedad de Medicina Interna del Uruguay en 1994.
Fue Presidente del XIII Congreso Nacional de Medicina Interna, realizado en 1982. Presidente de Honor del XXIV Congreso Nacional de Medicina Interna en 1997.
Miembro fundador de la Sociedad Latinoamericana de Medicina Interna en 1997 y Miembro Correspondiente Extranjero de la Sociedad de Medicina Interna de Buenos Aires desde 1980. Miembro Titular de la Asociación Médica Latinoamericana desde 1984. Fundador y Miembro de la Sociedad de Medicina Interna del Mercosur desde 1995.
Fue autor de 98 trabajos científicos publicados, dos de ellos premiados y coautor de diversos libros, destacándose el de Semiología Clínica por su amplia difusión entre los estudiantes de medicina.
Al frente de la Clínica Médica “1” actuó como un verdadero profesor, tanto para estudiantes de grado como de posgrado, poniendo énfasis en los aspectos semiológicos de la anamnesis y del examen clínico, con gran calidad docente y asistencial. Se recuerdan sus clases magistrales de anfiteatro, los acertados aportes en los Rounds Clínicos y Ateneos, así como en las reuniones científicas.
Destacó por su sabiduría, basada en el estudio y su vasta experiencia clínica, por su dedicación al paciente y sobre todo por su humildad.
Fue referente, consultante y maestro de quienes lo rodeaban, en particular, de médicos jóvenes y residentes que encontraban en él apoyo científico y humano, siempre dispuesto a atender una consulta y resolver junto al enfermo una duda diagnóstica, terapéutica o de conducta a seguir.
Se preocupó siempre por la jerarquización del trabajo de los médicos internistas, con defensa del régimen laboral y remuneraciones en diversas instancias de negociación con las instituciones mutuales, logrando importantes reconocimientos en ese ámbito para la Especialidad.
Entre sus pasiones fuera de la medicina se encontraban las carreras de caballos y el futbol, siendo un gran hincha del Club Atlético Peñarol.
Corresponde designar con el nombre de “Prof. Dr. Juan Miguel Cat” a esta Aula Docente, en reconocimiento de quien fue uno de los valores más sólidos de la medicina uruguaya y enseñó en el Hospital Maciel a tantas generaciones de estudiantes,
